Gospodarka wodna stanowi bardzo istotny element funkcjonowania Elektrowni ze względu na duże zużycie wody do celów chłodniczych. Dlatego też na potrzeby technologiczne wybudowany został sztuczny zbiornik wodny "Rybnik", który wraz z  zalewami: Grabownia, Gzel i Pniowiec, oddzielonymi bocznymi zaporami od zalewu głównego, należy do najważniejszych zbiorników wodnych regionu. Powierzchnia całkowita zbiornika wraz z zalewami bocznymi wynosi 555 ha, natomiast powierzchnia zalewu głównego wynosi 465 ha.

Zasadniczym źródłem wody powierzchniowej zużywanej w Elektrowni do chłodzenia urządzeń energetycznych jest zbiornik wodny "Rybnik". Przy maksymalnym eksploatacyjnym poziomie piętrzenia 221,00 m n.p.m. pojemność zbiornika głównego wynosi 21,4 mln m3. Natomiast wraz z zalewami bocznymi pojemność całkowita wynosi 24,0 mln m3. Maksymalny pobór wody ze zbiornika dla celów chłodniczych otwartego obiegu chłodniczego I etapu (bloki energetyczne nr 1 do nr 4) oraz uzupełnienia strat zamkniętego układu chłodniczego II etapu (bloki energetyczne nr 5 do nr 8) wynosi 38,9 m3/s.



Na uzupełnienie strat obiegu kotłowego pobierana jest woda powierzchniowa z zalewu bocznego "Grabownia" w ilości 25 do 40 m3/h, natomiast rezerwę stanowią trzy ujęcia wód podziemnych położone na terenie zakładu. Na potrzeby socjalne zakładu oraz w celu zaopatrzenia w wodę Przedsiębiorstwa Wodociągów i Kanalizacji w Rybniku, eksploatowana jest stacja uzdatniania wody w Stodołach, która aktualnie pobiera wodę z czterech ujęć wód podziemnych. Pobierana w ten sposób ilość wody powierzchniowej i podziemnej jest wystarczająca dla funkcjonowania Elektrowni "RYBNIK" S.A.

Powstające w procesach technologicznych ścieki przemysłowe oczyszczane są w obiektach oczyszczalni zakładowej,
a następnie wraz z częścią odsolin z chłodni kominowych odprowadzane są grawitacyjnie do zbiornika wodnego "Rybnik". Elektrownia posiada rozdzielony system kanalizacji. W zakresie ochrony wód uporządkowano gospodarkę wodno-ściekową zamykając istniejące obiegi wodne, a zrzut oczyszczonych ścieków odbywa się poprzez zakładową oczyszczalnię ścieków przemysłowo-deszczowych. Oprócz ilości odprowadzanych ścieków określana jest również ich jakość, która nie przekracza wskaźników wyszczególnionych w pozwoleniu zintegrowanym. Ścieki sanitarne powstające na terenie zakładu odprowadzane są do pobliskiej oczyszczalni miejskiej. Rocznie Elektrownia odprowadza do wód powierzchniowych ponad 4 mln. m3 ścieków przemysłowych i odsolin.

Uzyskiwane średnioroczne wskaźniki zanieczyszczeń ścieków przemysłowych:

Wskaźnik zanieczyszczenia	Jednostka	W ściekach		Wg pozwolenia wodnoprawnego
		wytworzonych	odprowadzonych
BZT5	g/m3	3	3	30
ChZT Cr	g/m3	35	35	150
zawiesina	g/m3	970	19	35
chlorki	g/m3	290	290	1000
siarczany	g/m3	165	165	500